Bilkent University Institutional Repository (BUIR)

Bilkent University Institutional Repository (BUIR), a service of Bilkent University Libraries, collects, preserves, and distributes the intellectual output of Bilkent University. Faculty, staff, and students are invited to deposit their research and scholarship. Departments, administrative units, programs, and centers are invited to use the Institutional Repository to distribute their working papers, technical reports, conference proceedings, and other research material. For assistance in depositing documents. For more information, please contact us.

 
openaccess

Scholarly Publications

openaccess

University Library

openaccess

Bilkent Theses

Recent Submissions

ItemEmbargo
Synthesis of magnetically anisotropic janus particles by droplet-based microfluidics
(Bilkent University, 2024-01) Saqib, Muhammad
In the past decade Janus particles have been extensively utilized by the scientific community for potential uses such as cell encapsulation and assembly, DNA assays, biological multiplexing , targeted drug delivery, noninvasive imaging, theranostics, microlenses, reflection-mode displays, removal of organic and metal pollutants and water decontamination. Due to their multi functional characteristics, stemming from their anisotropy, they are superior to conventional monophase particles. Even though there are several established synthesis methods for Janus particles, microfluidics-based methods are by far the most convenient and reliable due to low reagent consumption, monodispersity of the resultant particles and efficient control over reaction conditions. Droplet-based microfluidics is the most popular technique for the reliable synthesis of Janus particles and even though it has been extensively explored there are many aspects of the conventional droplet-based microfluidics techniques that either result in poor anisotropy of the synthesized particles or involve off-chip processing. In this work a simple and novel droplet-based microfluidic technique is utilized to synthesize magnetically anisotropic Janus particles. Using this method magnetically anisotropic Janus particles are synthesized by using droplets as templates. The droplets contain magnetic nanoparticles and are exposed to ultraviolet radiation while passing through a magnetic field. The magnetic field renders the droplet anisotropic by attracting the magnetic nanoparticles to one hemisphere while at the same time the ultrviolet exposure initiates polymerization of the prepolymer phase. The microfluidic device was optimized by using numerical simulations and experimental observations. The magnetic flux density was optimized by using a magnetic flux density map. The synthesized particles were imaged under an optical microscope to observe their size distribution and scanning electron microscope to confirm complete polymerization and the magnetic anisotropy was confirmed by observing the motion of the particle in the presence of an external magnetic field. The synthesized particles were observed to be monodisperse and exhibited rotation about their own axis which is characteristic of magnetically anisotropic particles. Further another design was developed to merge droplets from two dispersed phase streams in a Janus orientation by optimizing the angle of merging. With this device the merged droplet was observed to contain the constituents of its two hemispheres distinct from each other. Using this device TiO2-Fe2O3 and SiO2- Fe2O3 magnetically anisotropic Janus particles were synthesized. The synthesized Janus particles were observed under the optical microscope and the scanning electron microscope. Moreover the magnetic response of the Janus particles was also observed using a permanent magnet. These types of Janus particles could be potentially used as micromotors for microcargo transport because of their magnetic properties or for DNA assay applications.
ItemEmbargo
Augmenting bus factor analysis with visualization
(Bilkent University, 2024-01) Ahmed, Muhammad Umair
‘Bus factor’, also known as ‘truck factor’, is a measure of how vulnerable a software project is based on the minimum number of people who would have to leave the project (be ‘hit by a bus’) for it to stall. There is existing research on how to calculate bus factor for software projects but limited work on visualizing the bus factor. We believe providing visualization along with conventionally provided numerical bus factor results will help decision-makers manage the workload and knowledge distribution across the project and also help in planning and hiring decisions. This thesis proposes, implements, and evaluates a tool named BFViz to visualize bus factor and contributions for software projects from pre-processed Git history. It is a web application that provides a file-browser-like interface with an interactively navigable treemap. Additionally, it has filename-based filtering, individual contribution data for files and folders, and simulation of contributor departure. The tool is validated with a round of four user evaluations where users, ranging from project owners and engineering managers to developers, complete tasks using the tool on an open-source project that they are involved in and provide feedback with a semi-structured interview and a feature ranking activity. The overall task completion rate for the tasks was 79.55%. All case study participants preferred BFViz over text reports to understand bus factor data. The top three features, by mean ranking, were the contributors’ list, the files and folders’ visualization, and the simulation mode.
ItemRestricted
Farmasötik toksikoloji alanının gelişiminin tarihçesi
(Bilkent University, 2023) Gürbay, Erdem Alp; Şekerci, Yiğit Emin; Ekmen, Mehmet Akif; Türüt, Elif Nur; Bakirdöken, Batucan
Türkiye’de toksikoloji alanındaki gelişmeler, farmasötik toksikolojinin branşlaşmasıyla birlikte çok daha kapsamlı hale gelerek toksikoloji biliminin Türkiye’deki konumunu önemli ölçüde etkilemiştir. Bu makale, 1965-1983 yılları arasında farmasötik toksikoloji özelinde yapılan faaliyetleri ve akademik alanlardaki düzenlemeleri araştırır; araştırma geliştirme çalışmalarını ve farmasötik toksikolojinin diğer branşlarla olan bağlantısını inceler. Özellikle üniversitelerde yapılan düzenlemelerle birlikte eczacılık fakültelerinden ayrılarak bir anabilim dalı haline gelmesinin nedenleri, üniversitelerde ilk toksikoloji kürsülerinin açılması ve bu gelişmelerin sonuçlarına değinerek Türkiye’de farmasötik toksikolojinin gelişim sürecini aktarmayı amaçlar.
ItemOpen Access
Amerikan haşhaş krizinin Afyonlu çiftçiler üzerine etkileri
(Bilkent University, 2023) Malkara, Buğra; Bıyıkoğlu, Ece; Demirtaş, Göktuğ Ozan; Güler, Elif Sena; Ceyhan, Barbaros
Haşhaş Osmanlı Devleti’nden itibaren günümüze kadar ekilen ve mahsulleri uyuşturucu yapımında ve ilaç endüstrisi başta olmak üzere birçok alanda kullanılan bir bitkidir. Mahsullerinin uyuşturucu üretiminde kullanılması sebebi ile üretimi her dönemde denetlenmiştir. 1970’li yıllara gelindiğinde ise ABD’deki artan uyuşturucu bağımlılığı sebebi ile üretimi bir süreliğine Türkiye’de yasaklanmıştır. Araştırmamız öncelikli olarak, o dönemde önemli bir hasat olan haşhaşın yasaklanmasından öncesinde, yasaklanma sürecinde ve sonrasında Afyonkarahisarlı çiftçilerin ekonomik ve sosyal açıdan nasıl etkilendiğini yine Afyonkarahisarlı bir çiftçi olan Arif Yitik ile yapılan röportaj ve çeşitli belgeler kullanarak irdelemekte ve süreçte Türkiye-Amerika arasındaki politik süreci incelemektedir.
ItemRestricted
Türkiye’nin karanlık hatırası Ulucanlar Cezaevinin siyasi tarihi ve Türk kamuoyu aracılığıyla Türk ceza sistemine etkisi
(Bilkent University, 2023) Topalakcı, Arda; Doğan, Yiğit Ali; Malazgirtli, Nafiye; Öztürmen, Mihriban İdil; Şahin, Tuna
Ulucanlar Cezaevi, 1923 yılında askeri bir depo olarak inşa edilmiş bir kurum olup 1925’te bir cezaevi olarak kullanım görmeye başladı. 2004 yılına kadar hizmet veren bu kurum, uzun yıllar boyunca Türk toplumunu ve siyasetini çok farklı yönlerden etkiledi. Günümüzde idamların sıkça gerçekleştirildiği ve siyasi mahkûmların tutulduğu bir yer olarak bilinen Ulucanlar cezaevi tarihimizde karanlık ve en az bir o kadar da önemli bir yere sahiptir. Bu araştırmada, Ulucanlar Cezaevi ve Ulucanlar Cezaevinin tarihçesi ile ilgili belgelerden, raporlardan, kitaplardan ve Ulucanlar Cezaevi müzesinin müdürü Merve Bayıksel ile yapılan röportajdan yola çıkarak Ulucanlar Cezaevinin tarihi, Türk siyasetindeki yeri, cezaevinin koşullarını, Türk ceza sistemine ve kamuoyuna etkisi, günümüzde nasıl algılandığı ve Ulucanlar Cezaevinden çıkarabileceklerimiz anlatılmıştır. Türk tarihinin önemli bir bölümü faaliyet gösteren ve siyasi mücadele ve idamlar ile nam salan Ulucanlar Cezaevinin incelenmesi büyük önem arz etmektedir.