Altçizge modellemesi kullanarak kolon bez tespiti
Author
Özgül, Etkin Barış
Sökmensüer, C.
Gündüz-Demir, Çiğdem
Date
2011-04Source Title
IEEE 19th Signal Processing and Communications Applications Conference, SIU 2011
Publisher
IEEE
Pages
726 - 729
Language
Turkish
Type
Conference PaperItem Usage Stats
117
views
views
80
downloads
downloads
Abstract
Kolon adenokarsinomu, kolon bez yapılarında değişimlere yol açar. Patologlar bezlerdeki bu değişimleri değerlendirerek kolon adenokarsinom tanı ve derecelendirmesi yaparlar. Ancak değişimlerin değerlendirme süreci kaydadeğer öznellik taşıyabilir. Bezlerin matematiksel özniteliklerle karakterize edilmesiyle bu öznelliği azaltabilmek olasıdır. Bunun içinse ilk aşama, bezlerin yerlerinin otomatik olarak tespit edilmesidir. Literatürdeki bez tespit etme yöntemleri çoğunlukla piksel tabanlıdır. Ancak doku görüntüleri, doğaları gereği ve biyopsi hazırlama ve görüntü alma işlemlerindeki değişkenlik nedeni ile piksel bazında değişkenlik gösterebilir. Öte yandan, bu değişkenliğe rağmen, bezleri oluşturan doku bileşenlerinin uzaysal dağılımı benzer özellik gösterir. Bu dağılımı gözönüne alarak tasarlanan yöntemler, bölütleme başarısını artırma potansiyeline sahiptir. Bu çalışmada önerdiğimiz yöntem, ilk olarak, doku bileşenlerinin dağılımını, bu bileşenler üzerinde oluşturduğu bir çizge ile modeller. Daha sonra, oluşturduğu bu çizgeyi altçizgelere ayırır ve bu altçizgelerin öznitelikleri yardımıyla bezleri tespit eder. Kolon doku görüntüleri üzerinde yaptığımız çalışmalar, önerilen bu yöntemin bezlerin yüksek doğrulukta tespit edilmesinde umut verici sonuçlar verdiğini göstermiştir.
The colon adenocarcinoma causes changes in glandular structures of colon tissues. Pathologists assess these changes to diagnose and grade the colon adenocarcinoma. However, this assessment may consist of a considerable amount of subjectivity. It is possible to reduce this subjectivity by characterizing the glands with mathematical features. For that, the first step is to detect gland locations. In literature, most of the gland detection methods are pixel-based. However, tissue images may show pixel-level variances due to their nature and differences in biopsy preparation and image acquisition procedures. On the other hand, in spite of these variances, the distribution of tissue components forming glands show similar properties. The methods that consider this distribution has the potential of improving the performance. The method proposed in this study first models the distribution of the components by constructing a graph on them. Then, it breaks the constructed graph down into subgraphs and detects the glands using the features of these subgraphs. The experiments conducted on colon tissue images show that the proposed method leads to promising results for detecting the glands. © 2011 IEEE.
Keywords
Colon tissue imagesColon tissues
Detection methods
Glandular structures
Subgraphs
Tissue components
Tissue images
Pixels
Tissue
Signal detection
Permalink
http://hdl.handle.net/11693/28386Published Version (Please cite this version)
https://doi.org/10.1109/SIU.2011.5929753Collections
Related items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
Effect of double growth factor release on cartilage tissue engineering
Ertan, A.B.; Yilgor P.; Bayyurt, B.; Çalikoǧlu, A.C.; Kaspar Ç.; Kök F.N.; Kose G.T.; Hasirci V. (2013)The effects of double release of insulin-like growth factor I (IGF-I) and growth factor β1 (TGF-β1) from nanoparticles on the growth of bone marrow mesenchymal stem cells and their differentiation into cartilage cells were ... -
Surface-modified bacterial nanofibrillar PHB scaffolds for bladder tissue repair
Karahaliloǧlu, Z.; Demirbilek, M.; Şam, M.; Saǧlam, N.; Mizrak, A. K.; Denkbaş, E. B. (Taylor and Francis Ltd., 2016)The aim of the study is in vitro investigation of the feasibility of surface-modified bacterial nanofibrous poly [(R)-3-hydroxybutyrate] (PHB) graft for bladder reconstruction. In this study, the surface of electrospun ... -
Heparin mimetic peptide nanofiber gel promotes regeneration of full thickness burn injury
Yergoz, F.; Hastar, N.; Cimenci, C. E.; Ozkan, A. D.; Güler, Mustafa O.; Tekinay, A. B.; Tekinay, T.; Güler, Mustafa O. (Elsevier Ltd, 2017)Burn injuries are one of the most common types of trauma worldwide, and their unique physiology requires the development of specialized therapeutic materials for their treatment. Here, we report the use of synthetic, ...