Now showing items 1-4 of 4

    • The bonobo genome compared with the chimpanzee and human genomes 

      Prüfer, K.; Munch, K.; Hellmann I.; Akagi, K.; Miller J.R.; Walenz, B.; Koren, S.; Sutton G.; Kodira, C.; Winer, R.; Knight J.R.; Mullikin J.C.; Meader, S.J.; Ponting, C.P.; Lunter G.; Higashino, S.; Hobolth, A.; Dutheil J.; Karakoç, E.; Alkan, C.; Sajjadian, S.; Catacchio, C.R.; Ventura, M.; Marques-Bonet, T.; Eichler, E.E.; André, C.; Atencia, R.; Mugisha L.; Junhold J.; Patterson, N.; Siebauer, M.; Good J.M.; Fischer, A.; Ptak, S.E.; Lachmann, M.; Symer, D.E.; Mailund, T.; Schierup, M.H.; Andrés, A.M.; Kelso J.; Pääbo, S. (2012)
      Two African apes are the closest living relatives of humans: the chimpanzee (Pan troglodytes) and the bonobo (Pan paniscus). Although they are similar in many respects, bonobos and chimpanzees differ strikingly in key ...
    • Integrating sequence and array data to create an improved 1000 Genomes Project haplotype reference panel 

      Delaneau O.; Marchini J.; McVeanh G.A.; Donnelly P.; Lunter G.; Marchini J.L.; Myers, S.; Gupta-Hinch, A.; Iqbal, Z.; Mathieson I.; Rimmer, A.; Xifara, D.K.; Kerasidou, A.; Churchhouse, C.; Altshuler, D.M.; Gabriel, S.B.; Lander, E.S.; Gupta, N.; Daly, M.J.; DePristo, M.A.; Banks, E.; Bhatia G.; Carneiro, M.O.; Del Angel G.; Genovese G.; Handsaker, R.E.; Hartl, C.; McCarroll, S.A.; Nemesh J.C.; Poplin, R.E.; Schaffner, S.F.; Shakir, K.; Sabeti P.C.; Grossman, S.R.; Tabrizi, S.; Tariyal, R.; Li H.; Reich, D.; Durbin, R.M.; Hurles, M.E.; Balasubramaniam, S.; Burton J.; Danecek P.; Keane, T.M.; Kolb-Kokocinski, A.; McCarthy, S.; Stalker J.; Quail, M.; Ayub Q.; Chen, Y.; Coffey, A.J.; Colonna V.; Huang, N.; Jostins L.; Scally, A.; Walter, K.; Xue, Y.; Zhang, Y.; Blackburne, B.; Lindsay, S.J.; Ning, Z.; Frankish, A.; Harrow J.; Chris, T.-S.; Abecasis G.R.; Kang H.M.; Anderson P.; Blackwell, T.; Busonero F.; Fuchsberger, C.; Jun G.; Maschio, A.; Porcu, E.; Sidore, C.; Tan, A.; Trost, M.K.; Bentley, D.R.; Grocock, R.; Humphray, S.; James, T.; Kingsbury, Z.; Bauer, M.; Cheetham, R.K.; Cox, T.; Eberle, M.; Murray L.; Shaw, R.; Chakravarti, A.; Clark, A.G.; Keinan, A.; Rodriguez-Flores J.L.; De LaVega F.M.; Degenhardt J.; Eichler, E.E.; Flicek P.; Clarke L.; Leinonen, R.; Smith, R.E.; Zheng-Bradley X.; Beal, K.; Cunningham F.; Herrero J.; McLaren W.M.; Ritchie G.R.S.; Barker J.; Kelman G.; Kulesha, E.; Radhakrishnan, R.; Roa, A.; Smirnov, D.; Streeter I.; Toneva I.; Gibbs, R.A.; Dinh H.; Kovar, C.; Lee, S.; Lewis L.; Muzny, D.; Reid J.; Wang, M.; Yu F.; Bainbridge, M.; Challis, D.; Evani, U.S.; Lu J.; Nagaswamy, U.; Sabo, A.; Wang, Y.; Yu J.; Fowler G.; Hale W.; Kalra, D.; Green, E.D.; Knoppers, B.M.; Korbel J.O.; Rausch, T.; Sttz, A.M.; Lee, C.; Griffin L.; Hsieh, C.-H.; Mills, R.E.; Von Grotthuss, M.; Zhang, C.; Shi X.; Lehrach H.; Sudbrak, R.; Amstislavskiy V.S.; Lienhard, M.; Mertes F.; Sultan, M.; Timmermann, B.; Yaspo, M.L.; Herwig, S.R.; Mardis, E.R.; Wilson, R.K.; Fulton L.; Fulton, R.; Weinstock G.M.; Chinwalla, A.; Ding L.; Dooling, D.; Koboldt, D.C.; McLellan, M.D.; Wallis J.W.; Wendl, M.C.; Zhang Q.; Marth G.T.; Garrison, E.P.; Kural, D.; Lee W.-P.; Leong W.F.; Ward, A.N.; Wu J.; Zhang, M.; Nickerson, D.A.; Alkan, C.; Hormozdiari F.; Ko, A.; Sudmant P.H.; Schmidt J.P.; Davies, C.J.; Gollub J.; Webster, T.; Wong, B.; Zhan, Y.; Sherry, S.T.; Xiao, C.; Church, D.; Ananiev V.; Belaia, Z.; Beloslyudtsev, D.; Bouk, N.; Chen, C.; Cohen, R.; Cook, C.; Garner J.; Hefferon, T.; Kimelman, M.; Liu, C.; Lopez J.; Meric P.; Ostapchuk, Y.; Phan L.; Ponomarov, S.; Schneider V.; Shekhtman, E.; Sirotkin, K.; Slotta, D.; Zhang H.; Wang J.; Fang X.; Guo X.; Jian, M.; Jiang H.; Jin X.; Li G.; Li J.; Li, Y.; Liu X.; Lu, Y.; Ma X.; Tai, S.; Tang, M.; Wang, B.; Wang G.; Wu H.; Wu, R.; Yin, Y.; Zhang W.; Zhao J.; Zhao, M.; Zheng X.; Lachlan H.; Fang L.; Li Q.; Li, Z.; Lin H.; Liu, B.; Luo, R.; Shao H.; Wang, B.; Xie, Y.; Ye, C.; Yu, C.; Zheng H.; Zhu H.; Cai H.; Cao H.; Su, Y.; Tian, Z.; Yang H.; Yang L.; Zhu J.; Cai, Z.; Wang J.; Albrecht, M.W.; Borodina, T.A.; Auton, A.; Yoon, S.C.; Lihm J.; Makarov V.; Jin H.; Kim W.; Kim, K.C.; Gottipati, S.; Jones, D.; Cooper, D.N.; Ball, E.V.; Stenson P.D.; Barnes, B.; Kahn, S.; Ye, K.; Batzer, M.A.; Konkel, M.K.; Walker J.A.; MacArthur, D.G.; Lek, M.; Shriver, M.D.; Bustamante, C.D.; Gravel, S.; Kenny, E.E.; Kidd J.M.; Lacroute P.; Maples, B.K.; Moreno-Estrada, A.; Zakharia F.; Henn, B.; Sandoval, K.; Byrnes J.K.; Halperin, E.; Baran, Y.; Craig, D.W.; Christoforides, A.; Izatt, T.; Kurdoglu, A.A.; Sinari, S.A.; Homer, N.; Squire, K.; Sebat J.; Bafna V.; Ye, K.; Burchard, E.G.; Hernandez, R.D.; Gignoux, C.R.; Haussler, D.; Katzman, S.J.; Kent W.J.; Howie, B.; Ruiz-Linares, A.; Dermitzakis, E.T.; Lappalainen, T.; Devine, S.E.; Liu X.; Maroo, A.; Tallon L.J.; Rosenfeld J.A.; Michelson L.P.; Angius, A.; Cucca F.; Sanna, S.; Bigham, A.; Jones, C.; Reinier F.; Li, Y.; Lyons, R.; Schlessinger, D.; Awadalla P.; Hodgkinson, A.; Oleksyk, T.K.; Martinez-Cruzado J.C.; Fu, Y.; Liu X.; Xiong, M.; Jorde L.; Witherspoon, D.; Xing J.; Browning, B.L.; Hajirasouliha I.; Chen, K.; Albers, C.A.; Gerstein, M.B.; Abyzov, A.; Chen J.; Fu, Y.; Habegger L.; Harmanci, A.O.; Mu X.J.; Sisu, C.; Balasubramanian, S.; Jin, M.; Khurana, E.; Clarke, D.; Michaelson J.J.; OSullivan, C.; Barnes, K.C.; Gharani, N.; Toji L.H.; Gerry, N.; Kaye J.S.; Kent, A.; Mathias, R.; Ossorio P.N.; Parker, M.; Rotimi, C.N.; Royal, C.D.; Tishkoff, S.; Via, M.; Bodmer W.; Bedoya G.; Yang G.; You, C.J.; Garcia-Montero, A.; Orfao, A.; Dutil J.; Brooks L.D.; Felsenfeld, A.L.; McEwen J.E.; Clemm, N.C.; Guyer, M.S.; Peterson J.L.; Duncanson, A.; Dunn, M.; Peltonen L. (Nature Publishing Group, 2014)
      A major use of the 1000 Genomes Project (1000GP) data is genotype imputation in genome-wide association studies (GWAS). Here we develop a method to estimate haplotypes from low-coverage sequencing data that can take advantage ...
    • Molecular cloning and characterization of the common 1b subtype of HCV from Turkey 

      Öztan, Aslı (Bilkent University, 1999)
      Hepatitis C Virus is a major cause of acute and chronic hepatitis worldwide. 80-90% of Hepatitis C Virus infections become chronic and 75% of these cases lead to liver disease, including cirrhosis, liver failure and ...
    • Robustness of massively parallel sequencing platforms 

      Kavak P.; Yüksel, B.; Aksu, S.; Kulekci, M.O.; Güngör, T.; Hach F.; Şahinalp, S.C.; Alkan, C.; Saʇiroʇlu, M.Ş. (Public Library of Science, 2015)
      The improvements in high throughput sequencing technologies (HTS) made clinical sequencing projects such as ClinSeq and Genomics England feasible. Although there are significant improvements in accuracy and reproducibility ...